狄奥多西二世皇帝强制关闭东罗马帝国境内所有异教神庙后，雅典帕特农神庙被转化为了供奉圣母玛利亚的教堂。15世纪中期，奥斯曼帝国苏丹穆罕穆德二世吞并了雅典大公国，在其统治末期又将帕特农教堂改为了清真寺，甚至建立了宣礼塔。1687年9月26日，在摩里亚战争中，威尼斯人一度攻入雅典，当时奥斯曼土耳其军队将帕特农清真寺用于储存弹药，以为威尼斯人会投鼠忌器，然而威尼斯军队毅然开炮，并引爆了弹药库，给神庙（清真寺）造成了巨大毁坏。战争结束后，奥斯曼人恢复了对雅典的控制，并没有彻底重修，而是利用现场的石料，在帕特农内部另建了一座小清真寺。这个神庙内部的清真寺一直存在到了19世纪初期希腊王国独立。希腊独立并定都雅典后，有意清除了卫城内全部奥斯曼人的历史遗迹，包括这座小清真寺。但从18世纪至1839年，陆续有不少西方的旅行家、画家、考古学家留下了图画或照片，为这段特殊历史保留了见证。图1-4分别为苏格兰考古学家James "Athenian" Stuart 18世纪中期到访雅典后绘制的草图、爱尔兰画家Edward Dodwell 1801-06年间到访后绘制、苏格兰律师、画家詹姆斯·斯基恩1838年绘制以及法国商人Pierre-Gustave Joly de Lotbinière 1839年为雅典帕特农神庙拍摄的第一章照片。
