根据《民法典》第三百九十九条规定，宅基地使用权不得抵押，但法律另有规定的除外。这并未禁止宅基地上房屋的强制执行。《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》第二十条明确，唯一住房在符合条件时可予执行：申请执行人同意参照当地房屋租赁市场平均租金标准，从房屋变价款中扣除五至八年租金供被执行人租用房屋。
对于合法建造的宅基地房屋，其作为被执行人的合法财产，完全符合强制执行的基础条件。《最高人民法院、国土资源部、建设部关于依法规范人民法院执行和国土资源房地产管理部门协助执行若干问题的通知》第二十四条进一步规定，人民法院执行集体土地上的农村房屋时，可以与国土资源管理部门协商一致后予以处理。
宅基地房屋能否执行，首要考量的是权利合法性。若被执行人非本集体经济组织成员，通过买卖方式取得的宅基地房屋，因其违反《土地管理法》第六十二条关于农村村民一户只能拥有一处宅基地的规定，且宅基地使用权不得向集体外成员转让，此类房屋因权属存在瑕疵，通常无法进入强制执行程序。
反之，被执行人合法取得宅基地并建造房屋，享有完全物权的情况下，该房屋作为其责任财产，应当用于清偿债务。
三、执行程序中的特殊限制1. 竞买人资格限定根据《土地管理法》第六十二条，农村宅基地使用权实行严格的身份限制，仅限本集体经济组织成员享有。因此，司法拍卖中竞买人必须符合这一资格条件，否则即使竞买成功也无法办理产权过户。
2. 优先购买权保障《民法典》第三百零五条规定，按份共有人可以转让其享有的共有的不动产份额，其他共有人在同等条件下享有优先购买的权利。宅基地房屋常属家庭共有财产，执行时需保障其他共有人的优先购买权。
3. 被执行人基本生活保障参照《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》第二十条精神，执行宅基地房屋时应当从变价款中扣除五至八年租金，保障被执行人及其所扶养家属的基本居住需求，体现司法人文关怀。
四、流拍处理中的现实困境依据《最高人民法院关于人民法院民事执行中拍卖、变卖财产的规定》第二十五条，流拍后可依法以物抵债。但宅基地房屋流拍后，因申请执行人多不具备集体经济组织成员资格，无法通过以物抵债方式取得房屋所有权。实践中，法院通常只能解除查封措施，待符合条件时再行处置。
结语合法宅基地房屋可以作为强制执行标的，但须严格遵循身份限制、优先权保障和生活保障等特殊规定。司法实践中，应平衡申请执行人债权实现与被执行人基本权益保障，兼顾法律效果与社会效果，确保执行工作依法有序进行。