1950年，阿里埃勒·沙龙被调往中央军区司令部负责情报工作。随后被选派进入军校学习，得到伊扎克·拉宾的刻意栽培，以优异成绩毕业，分配到北方军区负责情报工作。1952年，沙龙从军队请假，开始在希伯来大学学习。1953年前9个月，巴勒斯坦敢死队的攻击，造成了32名以色列人死亡，为了报复巴勒斯坦敢死队对以色列的攻击，阿里埃勒·沙龙发起了一系列对约旦河西岸的报复性袭击，有效遏制了巴勒斯坦人袭击的行动，也大大提高了以色列军队的士气。1953年阿里埃勒·沙龙以少校军衔重返部队，沙龙率领突击队袭击阿拉伯武装领导人穆斯塔法·萨姆伊里，虽未成功但突击行动引起了上级的兴趣。受命组建专门的突击队——第101部队，这就是后来以色列特种部队的前身。1953年10月，一名以色列妇女苏珊娜和她的两个孩子，被扔进家中的手榴弹炸死，沙龙认定，袭击者来自约旦河西岸的凯比亚村，随率领101部队袭击凯比亚进行报复，在击退抵抗者后，以色列工兵奉命炸毁了村中的房屋，造成包括妇女儿童在内的69名平民死亡，45座房屋，1座学校，1座清真寺被摧毁。尽管沙龙事后辩解说当时不知道有人躲在房子里，但此次事件仍然受到了全世界的谴责。 由于这次事件，101部队被解散，奉命与089伞兵大队合并，组建089伞兵部队，沙龙成为指挥官，该营首当其冲地遭到了对恐怖主义基地和巴勒斯坦恐怖主义以及从事或协助恐怖主义活动的阿拉伯国家的报复。1954年7月，在对代尔巴拉附近的埃及哨所进行突袭时，沙龙受伤。
