当年，马季打师父侯宝林一事闹得沸沸扬扬。有人问侯宝林真假，侯宝林说：“别问这个了，旧社会徒弟打师父有的是。”
马季却说：“我从来没有打过侯先生，而且我一直认为侯先生是我的老师。”
1954年年初，北京市举行工人业余曲艺观摩汇演。新华书店工人马树槐（马季）出演了相声《找对象》，获得评委一致好评。
随后，马树槐代表出版印刷系统选拔，参加全国职工业余曲艺汇演。当时总工会非常看重这个节目，并请来了刘宝瑞和郭全宝，对他进行指导。
结果，马树槐不负众望获得了一等奖，北京代表团完胜天津代表团。当时候宝林看完马树槐的表演后，直接说了一句：“我可找着学生了。”
1956年，马树槐正式调到中央广播说唱团，成为一名专业的相声演员。当时中广说唱团相声领域的四大名师侯宝林、刘宝瑞、郭全宝、郭启儒对马树槐都非常喜欢。
几人对马树槐说：“你跟着我们学相声吧！”
马树槐听后，欣喜若狂。毕竟四位都是相声名家，跟着他们学习将来必定会有出息。之后中广说唱团领导也决定，让四人一起培养马树槐。
侯宝林担任他的责任老师，也就是师父，侯宝林觉得马树槐这个名字太绕口，便用《牡鹅少年马季》中主角的名字为他起了艺名马季。
虽然侯宝林是马季的责任老师，但并没有真正传授给马季传统相声，唯第一段《卖布头》还是马季从录音机里听侯宝林的录音学来的。
而且侯宝林知道后还非常不高兴，警告马季：“以后不要这么大胆，听了录音就敢上台表演传统活。”
随后还对徒弟们说：“你们尽量走新相声的路子，你们创作，我来负责润色和修改。”
在传统节目方面侯宝林给了马季几个文本，但不准他擅自演出。反而是刘宝瑞教了马季很多传统活，其中周总理最喜欢的《豆腐堂会》，就是刘宝瑞教给马季的。
后来马季去天津找到闫笑儒学的《卖布头》，不仅如此，闫先生还把《卖布头》的所有版本垫话都教给了马季，连口气节奏这种只有拜师才能教的也都倾囊而授。
但是随着国内运动浪潮越来越高涨，传统一度成为被批评的对象，而很多老艺人也成为斗争的对象，刘宝瑞先生甚至因此失去了生命。
侯宝林和马季也未能幸免，侯宝林也一度成为批评的重点，马季作为“先锋”站在现场的第一排。批评现场，侯宝林被问话：
“侯宝林，你是不是写过《寸步难行》，在相声里怎样怎样？”
侯宝林：“我没有，那是马季写的。”
于是马季被批评教育一番，然后又接着说到相声《画像》、《西方音乐》，而侯宝林统统推到了马季身上，就这样，批斗对象由侯宝林转移到马季这里。
据说反反复复4次之后，马季气不过就打了师父侯宝林一个耳光。因为作品确实是他写的，可出作品时署名都是师徒创作，师父在前，徒弟在后。
然而出事后，侯宝林却把所有的责任都推到马季一人身上，让徒弟一人扛，才使得马季怒火中烧，忍不住打了师父侯宝林一巴掌。
对于这一说法，曾有记者问侯宝林，他说：“别问这个了，旧社会徒弟打师父有的是。”
对此，马季也说：“我觉得没有这些，就没要生活，没有这些误会，没有挨骂，没有谣言，就前进不得，任何人都是。”
两人的回答模棱两可，侯宝林的意思是“打过”但我不计较，马季的意思似乎是“没打”，但要给老师几分颜面也可以说“打了”。
直到2007年，马季去世后的50多天后，他生前所著的遗书《一生守护》中，回应了“打师父”的传闻。
“我可以很明确的告诉读者，我从来没有打过侯先生，而且，我一直认为侯先生是我的老师。”
后来，马季的儿子马东在做客郭德纲节目时，也斩钉截铁的说：“就俩字，没有！”
无论有没有，十年动乱结束后，两人的关系也逐渐恢复。1984年，马季应邀前往香港演出，而侯宝林也是那次演出的艺术顾问。
在正式演出前的内地审查表演中，马季的作品大受欢迎。当时侯宝林对马季说：“马季，你过来，到香港之后，我的段子你都可以演。”
然后马季非常开心，他觉得这是侯先生对他的认可，于是便对侯宝林说：“侯先生，您放心吧！”
这时的二人也放下恩怨，重新开始。
1993年，侯宝林弥留之际，马季前来探望，侯宝林。拉着他的手说：“马季，相声的即兴发挥千万不能丢掉啊，它是咱们相声的主要技巧。”
如今马季的徒弟姜昆与侯宝林儿子侯耀文的徒弟总是发生摩擦，看来是再续马季与侯宝林的前缘了，只是后者已经放下恩怨，郭德纲和姜昆还会远吗？
