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长野县·八岳连峰未宝岳。

长野县警的大和敢助在雪山中追捕“某个男人”时，突然视线中出现了某人的身影。就在他分神的一瞬间，“某个男人”射出的步枪子弹擦过了敢助的左眼，伴随着巨大的地震声，雪崩随之发生。敢助被雪崩吞噬……

十个月后。

接到国立天文台野边山设施的一名研究员被袭击的通报后，奇迹般从雪崩中生还的敢助和上原由衣赶往现场。就在进行情况询问的过程中，天文台巨大的抛物面天线开始转动，负伤而变成独眼的敢助的左眼突然剧烈疼痛起来……

当天夜晚，毛利侦探事务所接到了一个电话。打电话的人是被称为“鳄鱼”的刑警，他是小五郎在警视厅时期的好友。他告诉小五郎，他正在调查未宝岳雪崩事故，而案件档案中出现了小五郎的名字。

小五郎与“鳄鱼”约定了之后见面，柯南也跟了过去。然而，在前往约定地点的路上，突然传来了清脆的枪声……